对皇后下毒的谋逆案件有关联，谋逆乃是十恶不赦的大罪，谁也不敢包庇，一旦牵连其中，不仅自己会掉脑袋，还会连累整个家族，因此，三大衙门的官员，即便心中想包庇文官，也不敢冒这个风险。
除此之外，还有一个更重要的原因，新皇马上就要登基了。朱慈烺的性格，三大衙门的官员们都十分清楚，他杀伐果断，嫉恶如仇，对贪腐、谋逆之人，从来不会姑息迁就。这些官员，都想在新皇登基之后，能够继续在朝堂之上立足，能够得到新皇的信任和重用，因此，这一次，他们必须把事情做得彻底，必须严惩所有涉案人员，以此向新皇表明自己的忠心，表明自己公正无私的态度，否则，一旦惹得新皇不满，倒霉的肯定是他们自己。