出征作战，军纪作风更是要反复强调告诫，此番西征亦然。
进兵途中，随著连番的胜绩，苟政的威望比起之前，更有显著提高，到长安后，更达到一段高峰。而苟军将士们，对苟政的命令，也大多表示服从，包括纪律作风上的限制要求。
但这种服从性，仅针对自河东出发的将土，并不包括一路走来，那些招降纳叛的将士。这些新加入苟氏集团的将士，来源不一，成分复杂，不提战力，不提忠心，但他们的表现也很符合“兵贼不分家”的现象。
进长安后，违背军令，侵犯士民最多的，恰恰是那些降卒、义士，是那些“关西兵”。对此，苟政足足花了七日的时间，斩杀了两百多名违法乱纪的军官士卒，才把那些“匪兵”给镇压住。
当兵乱消除，那么人心自安，而比起进城时的威风赫赫，对于自己军队的严厉约束与惩戒，则是苟政带给长安、京兆乃至三辅士民最深刻的影响。
在此之前，苟政的“约法三章”，也已传遍历秦雍。对于这条，关西士民态度各异，有欣然称道的，也有之以鼻的。
不过随著苟政重视军纪的名声与措施传开后，很多杂声也的确消沉不少，在辐射影响最重的长安、京兆地区，则有不少士民们，开始真正视其为“义师”。
等军纪问题得到控制之后，苟政随即开始著手对军队进行整编了，这是势在必行的事情，与诸营部将领，也达成了一致共识。
毕竟，三万多军卒，素质参差不齐，各部数量也不一，对军队指挥与战斗力的影响实在太大。此前战事紧急，没有时间，长安既下，取得阶段性胜利之后，
也该著手进行整顿与编练，这是为长远计。
于是，在苟政的主导下，一场覆盖所有长安苟军的大整编，轰轰烈烈展开了。这场整编，基本上是在原来中军各营的基础上展开的，并且将苟旦、苟威、
孟淳、郑隽等“外军”，一并囊括在内，进行统一规划。
而比起此前数次整编，这次规模更大，力度也同样空前。首先在编制上，有了更为明确的规定，魔下诸营，战卒限定在1500卒，分3幢9队81什。
其次对各级军官的称呼进行变更，改“主”为“长”，如此前军主、幢主、
队主之类的称呼，私兵部曲，人身依附的性质，实在太过浓烈，不利于苟政实现真正的军令统一。
在当前的苟军队伍中，这种人身依附关系，也是普遍存在的，甚至可以说，